一、源于子姓。商朝末，纣王叔父比干，商之贤臣，因直谏而被杀，子孙避难改姓，其中一支以本为王族子孙之故，遂姓孙氏。

二、源于姬姓。公元前1055年，周公姬旦封康叔於卫（今河南淇县），建立卫国。春秋时，他的八世孙姬和因为攻灭西戎有功，被周平王赐为公爵，史称卫武公。卫武公有一个儿子名叫惠孙，惠孙的孙子名乙，字武仲，又叫武仲乙，把祖父惠孙的字作为姓氏，姓孙。因此武仲乙又称孙乙，他的后代就以孙为姓。孙武、孙膑、孙权也是孙乙的后裔。

三、源于妫姓。公元前1046年，周灭商，周武王封舜帝的直系后裔妫满于陈国。公元前672年，陈厉公妫跃之子陈完逃奔齐国，改陈氏为田氏。齐景公时，陈完五世孙田桓子，即齐大夫田无宇，其子田书因伐莒有功，齐景公封田书于乐安，古城在今山东惠民，并赐姓孙氏。

四、源于芈姓。春秋初，楚王蚣冒之孙蒍贾，蒍贾之子蒍艾腊，也称孙叔敖，孙叔为其字，出任楚庄王的令尹，其子孙以其字为氏。

五、源于荀姓。汉朝时，因汉皇室成员刘询当了皇帝，即汉宣帝，为了要避“询”音之讳，他下令荀姓子孙不得再姓荀，一律改为孙氏，并将战国时代的荀卿都改为孙卿。由是荀姓也成为汉朝“孙”姓支脉的一个源头。

六、源于冒姓。属于因故改姓为氏。夏侯婴，与刘邦是少时朋友，夏侯婴做过“滕令奉车”官职。等到其曾孙夏侯颇娶公主为妻，该公主随母亲外家的姓，称“孙公主”，这使夏侯颇的子女也跟随母亲外家的姓为孙。

七、源于其他赐姓、改姓

1.属于以帝王赐姓为氏。

三国时期东吴将领俞河因功而被赐姓孙，因称孙河。孙河，本姓俞，年少时即随孙坚征讨沙场，孙坚视他作心腹。后又随孙策平定江东，多立战功，孙策赐姓予他为孙，因而改姓。

2.属于避难改姓为氏。

⑴山东《郓城县志》据李集乡军李村《李氏族谱》记载，李氏原姓轩辕氏，先祖轩辕斌，明初在朝为官，奉命往梁山平乱，便落籍郓城。后因奸臣陷害，为避灭门之祸，遂将轩辕氏改为孙、轩、李三姓，隐居四方。

⑵史籍《明史》记载，明朝中叶，有一名士叫孙一元，原来是安化王的宗族后裔，本为朱氏。明永乐十九年（公元1492年），庆靖王朱栴的第四子朱寘鐇承袭了安化的封地（今陕西庆阳与甘肃安化一带）。这个朱寘鐇曾一直认为自己是皇位当选人。事后，朱一元怕受株连，所以变姓名为孙一元，携家避难躲入太白山中隐居。在朱一元的后裔子孙中，皆沿袭祖先所改之姓氏，称孙氏，世代相传。

3.源于各民族变姓，属于汉化改姓为氏。

⑴新罗初期，高丽学者金富轼撰著的《三国史记》中记述了孙氏的起源。新罗初期，朝鲜遗民分居山谷之间，分别为阏川杨山部、茂山大树部等六部，均以朴为姓。到新罗第三代王朴儒理尼师改六部名称，并分别赐姓，其中的茂山大树部改名渐梁部，并赐姓孙。

⑵唐朝时期，安禄山的部将孙孝哲，官至大将军，安禄山僭位后拜殿中少监，为契丹族人。

⑶元代时期，曾任大都督的塔海，其后世子孙改姓孙，定居于山西省唯一的蒙古族聚居村——盂县秀水镇东白水村。

⑷明朝初年，朱元璋禁止臣民使用胡姓，胡姓多为复姓，如公孙、叔孙，长孙，土孙、王孙、孟孙、仲孙、季孙、室孙、宫孙之类的复姓也在被禁之例，这类含“孙”字的复姓不得不省字而改孙氏。

⑸清朝时期，满洲八旗姓孙佳氏全族改孙氏。满族建立清朝之后，仿汉姓成普遍现象，孙佳氏取其首音，选“孙”作为姓。另有鲁布哩氏改姓孙氏。

⑹在景颇族的二十六个大姓中，格亮姓是景颇族的祖先，其他各姓都是由她繁衍而出的，格亮姓汉化为孙氏。另有木如氏、堵引氏等小姓的汉姓也都改为孙氏。另外，佤族中的木依库氏音译为孙氏。在今苗族、阿昌族、哈尼族、土家族、黎族、傣族等少数民族中，均有孙氏族人分布，其来源大多是在唐、宋、元、明、清时期中央政府推行的羁糜政策及改土归流运动中，流改为汉姓孙氏，世代相传至今。