云从国画，师法古人而创新，师造化而独特。山水画，融宋元诸家笔墨、丘壑于一体，“以黄公望的瘦树、山石为之纵横，润以马远泼墨之法”，而能随意成卷丈余。其间丘壑布置，千变万化，层出不穷，使人观之不厌；岩石林木的表现，深厚坚实，穿插有致；不论水墨着色，皴擦喧染，都苍劲秀润，呈现出空间深度；点景人物，自然生动，屋宇、舟车、驮马安排得体。早期作《秋山行游图卷》，显露才华，清乾隆阅后题诗“几点萧萧树，疏皴淡淡山。由来以意胜，无不寓神间。秋景宜寥廓，客人自往还。粗中具工细，识语破天悭”。后应万选之请，为《太平三书》绘制《太平山水图》，将太平州所属地区山水，绘图43幅，其中：太平山水图一幅，当涂风景15幅，芜湖风景14幅，繁昌风景13幅，每幅题古诗一首，说明仿某古人之画幅，没有雷同，各具特色。还有《闭门拒客图》、《西门恸哭图》、《秋山访友图》、《江山览胜图卷》、《归寓一元图卷》、《磵谷幽深卷》、《崔华诗意卷》等。人物画，继承发扬李公麟的白描技法，代表作为《离骚图》，人物造型准确，神态动人，点缀景物，赋有生命，云从对《离骚》感触甚深，作《天问》插图，绘制《九歌图》，清高宗得尺木《离骚图》后，命侍臣补绘重刻，并题《山水图卷》云“四库呈览《离骚图》，始识云从其人也，……览观长卷四丈余，观之不厌意不舍”。 云从深恶官僚，清初，拘节守志，不肯臣事，不结权贵。顺治十七年（1660），太平知府胡季瀛，求画不与。1662年，重修大自楼，故强其绘太白楼壁画。出于对大自的热爱，“画匡庐、峨嵋、泰岱、衡岳四大名山，凡七日而就，遂绝笔。”志行高洁，为人敬慕。新安画派大师渐江，曾师其下，后代临摹者愈众。顺治五年戊子（1648），《太平山水图》刻本，顺治二年乙酉（1645），《离骚图》刻本，曾流传日本。《太平山水图》为大坂兼葭堂收藏，《离骚图》为日本美术史家大村西崖收入《图本丛书》刊行。《秋山游图卷》，为东京帝室博物馆所藏，对日本南画勃兴起着促进作用。云从晚年结识铁匠汤天池，指导天池以铁作画，创制铁画。 1673年，云从“执诸同志手，曰：‘道在六经，行本五伦，无事外求之，仍衍其旨。赋诗毕，瞑去”，享年七十八岁，葬于芜湖城西严家山。其诗由后学编成《梅花堂遗稿》，继后，黄钺将云从和汤燕生之诗编成《肖、汤二老遗诗合编》。其画为故宫博物院、安徽省博物馆所珍藏。1986年，芜湖市人民政府，在镜湖之畔筑“尺木亭”，并以紫铜铸其全身坐像于亭畔，供人瞻仰。